思影科技将于2018年6月8日-- 2018年6月13日(周五-下周三)举办第七届功能磁共振数据处理基础班(详见课表安排)。
1、培训简介
功能神经影像技术已成为研究认知和脑疾病的重要手段。利用神经影像技术(如静息态和任务态fMRI,弥散张量成像DTI,脑网络等),研究人员可以更深入地理解脑疾病及寻找治疗靶点,近10年来,国际上基于该技术在脑疾病、心理与认知科学、人工智能等领域发表的论文数量呈指数级上升趋势,国内学界也开始在脑科学研究领域发力。然而许多临床医生及研究者对数据处理并不十分了解,限制了科研进度。
扎实掌握相关数据处理技术是脑影像研究的关键,为此,思影科技拟举办磁共振脑成像数据处理分析基础班,通过手把手教学,帮助临床医生与初入门的科研人员快速掌握磁共振脑影像数据处理分析操作技能,从而提高专业人员开展神经影像相关研究工作的水平。
2、培训对象与内容
此次培训的对象是希望利用脑影像技术进行脑科学研究的医生、高校教师与在校学生等,思影科技一直坚持小班教学的方式,并配备教辅人员,后续提供在线支持,及时解决学员数据处理中存在的问题。
培训内容主要包括:fMRI技术的基础知识、实验设计、静息态数据预处理与统计检验(初步、高级统计及多重比较校正),软件作图,任务态数据处理,脑网络构建及复杂网络分析,SPM、GRETNA操作,独立成分分析(ICA),弥散张量成像(DTI)数据处理等。
注:如方便,请于会议开始前一天到达会场(10:00 - 20:00)熟悉场地及安装软件、拷贝资料等事宜。
3、培训课程安排
时间
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课程名
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主要内容
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第一天
6月8日
杨田雨
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上午
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软件、数据准备
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• 静息态磁共振功能成像基础介绍
• MATLAB软件与内部指令集一览
• 功能磁共振数据处理软件包的介绍与安装
• 静息态脑成像数据的采集与准备实例
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下午
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数据预处理
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• 磁共振研究文件数据规范化管理
• SPM介绍
• 预处理方法与常用预处理流程
• 静息态数据的预处理实操
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第二天
6月9日
龙治良
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上午
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静息态功能指标
计算
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• ALFF、ReHo指标计算
• Voxel-wise功能连接计算
• ROI-wise功能连接计算
• VMHC、FCD指标计算
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下午
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统计初步
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• SPM单样本t检验分析
• SPM双样本t检验分析
• SPM配对t检验分析
• 功能连接矩阵的统计分析
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第三天
6月10日
龙治良
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上午
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Advanced统计&多重比较
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• SPM单因素方差分析
• SPM双因素方差分析
• 多重比较矫正(FWE,FDR,GRF和Alphasim)
• 制作表格,结果汇总
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下午
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软件画图
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• MRIcroN介绍和画图
• BrainNet
Viewer介绍和画图(差异图和连接图)
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第四天
6月11日
王金辉
杨田雨
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上午
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GRETNA上机操作1
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• 用静息态fMRI example data演示和讲解数据预处理、网络构建
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下午
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GRETNA上机操作2
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• 用静息态fMRI example data演示和讲解网络属性分析、统计比较、结果呈现
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晚上
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ICA原理、GIFT操作
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• Group ICA原理
• GIFT软件实战
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第五天
6月12日
何清华
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上午
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实验设计和E-prime实现
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• fMRI实验设计简介和软件实现
• Eprime软件详细介绍
• Eprime组件和示例
• inline语句,程序设计
• Edata数据提取与分析
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下午
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任务相关fMRI数据处理
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• 任务相关fMRI数据分析流程简介
• first-level
analysis
• Second-level
analysis
• AAL工具包查看激活图
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第六天
6月13日
谢桑马
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上午
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DTI数据介绍与VBA处理
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• DTI原理简介
• DTI数据处理概况
• FSL及其运行环境简介
• VBA数据处理介绍
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下午
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TBSS数据分析原理与实践
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• TBSS数据处理原理
• TBSS数据处理实践
• 预处理的批处理实现
• 其他一些DTI数据分析方法概述
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4、培训人数
此次培训限定人数20人左右,报名敬请从速。
5、培训地点
重庆市渝中区青年路38号重庆国贸中心2004#,具体见会议指南。
6、培训费用
所有参会人员3500/人(含资料费、培训费,交通及住宿费自理)。
7、报名方式
请将报名回执发送至:syfmri@163.com,我们会第一时间联系您。
8、缴费方式
银行转账或者支付宝(18580429226,户名:杨晓飞),谢绝录像,主办方提供发票。
9、联系方式
联系人:彭庭烨。电话:023-63084468/15123187262。
10、备注
请各位培训学员自带笔记本电脑(Windows
64位系统、i5、4G内存、50G剩余存储空间等基本配置;苹果Mac电脑用户如方便请提前使用Bootcamp加装Windows 64位系统);学员自己有数据的可以带3-5例进行现场处理;并在6月1日前进行缴费及将回执表发给彭小姐,便于培训安排。
报名回执表
单位名称、税号
(发票抬头)
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姓名
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性别
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QQ
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电话号码
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科室/专业
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缴费方式
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□转帐 □支付宝 (请选择在□打√)
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银行信息
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户名:重庆思影科技有限公司
账号:123909127710102
开户银行:招商银行重庆分行渝中支行
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汇款备注
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第七届功能磁共振数据处理基础班
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注:请完整填写回执表后回传给我们,以便给你发送确认函,谢谢支持!
11、在线支持服务
思影科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持与合作,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理方法。
12、培训人员简介:
龙治良,博士,西南大学,讲师。具有应用数学(本科,硕士)和生物医学工程(博士)交叉学科背景。研究方向为基于多模态脑网络水平的脑疾病病理机制研究。在英国牛津大学做访问学者一年。目前参与多项国家自然科学基金项目,发表学术论文10余篇,第一作者论文5篇,包括Movement Disorders,Scientific
Report。论文被引537次(google
scholar)。擅长脑形态学分析、功能连接分析和脑网络分析。
何清华,北京师范大学理学博士,美国南加州大学博士后、访问学者,西南大学心理学部教授、博士生导师,重庆市脑科学协同创新中心西南大学分中心课题组长(PI),国家自然科学基金通讯评审专家,中国心理学会决策心理学专业委员会委员,中国心理学会青年工作委员会委员,重庆心理学学会第五届国际学术交流工作委员会副主任,西南大学心理学部国际合作与交流中心主任,SSCI收录1区杂志Frontiers in Psychiatry和Frontiers in Psychology副主编,获得2017年获重庆市留学回国人员创业创新支持计划的支持。以第一作者和通讯作者的形式在国内外高水平杂志或SCI/SSCI杂志上发表论文20余篇,包括Brain Structure & Function、The Journal of Neuroscience、NeuroImage、Neuropharmacology、Progress in Neuropsychopharmacology &
Biological Psychiatry等。论文的总计被引次数为1000余次,H指数为18,H-10指数为30。担任Biological Psychiatry、NeuroImage、Cortex、Journal of Personality Disorders等国际知名杂志审稿人。
王金辉,博士,杭州师范大学认知与脑疾病研究中心研究员。主要研究方向为基于多模态神经影像技术的复杂脑网络方法学和临床应用研究。近年来,在本领域国际主流学术期刊Biological Psychiatry、Radiology、Human
Brain Mapping等发表SCI论文50余篇,其中多篇论文被遴选为期刊封面论文。相关研究成果被Nature系列、Science、Neuron、PNAS等国际顶尖期刊多次正面引用,引用次数达5000余次,H指数28(google
scholar)。7篇研究论文入选ESI Top 1%高被引论文。荣获2014年度美国生物精神病学协会Ziskind-Somerfeld研究奖。作为核心成员开发了“脑网络分析工具包GRETNA”,该工具包被Matlab团队遴选为12个高质量的神经科学工具包之一。主持参与多项国家、省部级项目。担任Frontiers
in Human Neuroscience副主编、Open Neurology Journal编委。担任Cerebral Cortex等20余个国际期刊的审稿人。
谢桑马,博士,2017年1月毕业于中国科学院自动化研究所。主要研究方向为扩散磁共振成像的计算理论和方法、脑影像数据分析软件开发以及扩散磁共振成像在精神疾病中的应用。扩散磁共振成像分析软件DiffusionKit的主要开发者,获得软件著作权一项。熟练掌握扩散磁共振成像领域的主流方法,精通相关软件的操作使用。目前,已在PLOS
ONE、Journal of Neuroscience Methods、Translational Psychiatry等国际杂志以第一作者发表SCI论文3篇,参与多项国家自然基金项目,同时担任国际期刊IEEE
Transactions on Medical Imaging等杂志审稿人。
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